AB Destekli Uluslararası Workshop: "Computational Approaches in Life Sciences and Aquaculture (CALSA’25)"
Avrupa Birliği (AB) tarafından fonlanan COST BIOAQUA (CA22160) konsorsiyumu kapsamında, TÜBİTAK Temel Bilimler Araştırma Enstitüsü (TBAE) ev sahipliğinde 20–24 Ekim 2025 tarihleri arasında beş gün sürecek “Computational Approaches in Life Sciences and Aquaculture (TBAE CALSA’25)” adlı uluslararası bir workshop düzenlenecektir.
Etkinlik, üniversitemiz Moleküler Biyoteknoloji Bölümü öğretim üyesi Prof. Dr. Orkide COŞKUNER-WEBER ve araştırma görevlisi Arş. Gör. Dr. Semih ALPSOY’un yer aldığı COST konsorsiyumu tarafından organize edilmektedir.
Workshop’un Konusu ve Amacı
TBAE CALSA’25, su ürünleri yetiştiriciliği alanında çalışan erken kariyer ve deneyimli araştırmacılara, biyoinformatik, makine öğrenmesi, kuantum merkezli hesaplamalar ve moleküler simülasyonları kapsayan modern ve entegre bir araç seti kazandırmayı hedeflemektedir. Katılımcılar;
- Genom ve transkriptom montajı,
- Popülasyon ve eDNA metagenomikleri,
- Mikrobiyom analizleri,
- Sağlık, beslenme, çevresel dayanıklılık ve refah tahminine yönelik modelleme
gibi konularda uçtan uca hesaplama yöntemlerini öğrenme fırsatı bulacaktır. Uygulamalı oturumlarda yeniden üretilebilir makine öğrenmesi iş akışları, kuantum tabanlı fizikokimyasal özellik hesaplamaları ve çok ölçekli moleküler simülasyon teknikleri üzerinde çalışılacaktır. Ayrıca etkinlik boyunca FAIR veri ilkeleri, açık kaynaklı araçlar ve hackathon tarzı uygulama oturumları ön planda tutulacaktır.
Eğitmen Kadrosu
Üniversitemizden Prof. Dr. Orkide COŞKUNER-WEBER ve Arş. Gör. Dr. Semih ALPSOY’un yanı sıra, Acıbadem Üniversitesi, Kadir Has Üniversitesi, Güney Florida Üniversitesi ve IBM’den değerli uzmanlar da eğitmen olarak yer alacaktır.
Ayrıca, Moleküler Biyoteknoloji Bölümü yüksek lisans öğrencimiz İrem Argın ile bölüm mezunumuz ve şu anda Gebze Teknik Üniversitesi yüksek lisans öğrencisi olan Sinan Eyüboğlu da eğitmenler arasında bulunmaktadır.
Katılım ve Başvuru Koşulları
Etkinlik herkesin online katılımına açık olacaktır. Ancak yüz yüze katılım için yüksek lisans, doktora ve doktora sonrası araştırmacıların başvuruları öncelikli olarak değerlendirilecektir.
Matematik, fizik ve biyoloji derslerini almış; ayrıca Python programlama dili konusunda yetkin adaylar tercih edilecektir. Bu kapsamda başvuru aşamasında transkript talep edilmektedir.
Başvurular 13 Ekim 2025 tarihine kadar https://tbae.tubitak.gov.tr/computational_life_sciences_and_aquaculture adresi üzerinden yapılabilir. Daha detaylı bilgiye TÜBİTAK’ın resmi sayfasından ve etkinlik posteri üzerinden ulaşılabilir.
Program akışı güncellenecek olup, nihai versiyonu en kısa zamanda duyurulacaktır.
